Show simple item record

dc.contributor.authorØvredal, Lisa Birgit Sjåstad
dc.date.accessioned2019-06-22T00:32:08Z
dc.date.issued2019-06-22
dc.date.submitted2019-06-21T22:00:09Z
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/1956/20380
dc.description.abstractVibrio anguillarum og en Vibrio ordalii-lignende bakterie har de siste årene vært et økende problem hos en rekke nyere marine arter det drives oppdrett av i Norge, spesielt rognkjeks. Lite studier er gjort av populasjonsgenetikken til Vibrio ordalii-lignende isolater fra Nord-Atlanterhavsområdet. For å kunne utvikle effektive og gode vaksiner og for å kunne gjøre smittesporing av vibriose mulig, er det helt nødvendig å studere populasjonsgenetikken mellom isolater som forårsaker sykdom. Studier av Steinum et al. (2016) fant at det eksisterer flere ulike populasjoner innen isolater fenotypisk forenlig med Vibrio ordalii. Samme studie fant også at to isolater hentet fra syk torsk i Norge, som deler samme fenotypiske karakteristika med Vibrio ordalii fra Stillehavet, plasserer seg genetisk nærmere Vibrio anguillarum (Steinum et al., 2016). Derfor var det behov for analyser av flere Vibrio ordalii-lignende isolater fra Nord-Atlanterhavsområdet, for å kartlegge dette nærmere. Hovedmålet med denne studien var derfor å studere populasjonsgenetikken hos en rekke Vibrio anguillarum, Vibrio ordalii og Vibrio ordalii-lignende isolater. Med spesielt fokus på hvordan Vibrio ordalii-lignende isolater plasserer seg i forhold til Vibrio ordalii og Vibrio anguillarum. MultiLokus Sekvens Analyse (MLSA) og MultiLokus Sekvens Typing (MLST) ble utført på åtte husholdningsgener; atpA, ftsZ, gapA, gyrB, mreB, rpoA, topA og pyrH som ble sekvensert og analysert. Resultatene fra analysene viste nært slektskap mellom Vibrio anguillarum og Vibrio ordalii, samt en relativt betydelig avstand mellom Vibrio ordalii og Vibrio ordalii-lignende isolater. Vibrio ordalii-lignende isolater plasseres i to svært nære grupper, basert på geografi. MultiLokus Variable Nummer Tandem Repeterende Analyse (MLVA) ble også utviklet og utført. Funnene var forenlig med MLSA/MLST om Vibrio ordalii-lignende isolater, og gav videre en høyere oppløsning av slektskapsrelasjonen mellom isolatene i de to nære gruppene. Isolatene deles inn i 11 ulike VNTR-typer, og grupperes fortsatt etter geografiske områder. Engelske isolater grupperes for seg, og et torske-isolat-gruppers alene. Dette kan indikerte at det trolig finnes ulikheter mellom de Vibrio ordalii-lignende isolatene.
dc.language.isonob
dc.publisherThe University of Bergen
dc.subject
dc.titleGenetisk analyse av Vibrio anguillarum, Vibrio ordalii og Vibrio ordalii-lignende isolater isolert fra syk rognkjeks
dc.typeMaster thesis
dc.type.degreeMasteroppgave i fiskehelse
dc.type.courseFISK399
dc.subject.archivecodeMastergrad
dc.subject.nus759906
dc.type.programMAMN-FISK
dc.date.updated2019-06-21T22:00:09Z
dc.rights.holderCopyright the Author. All rights reserved
dc.embargo.liftdate2020-06-03
dc.embargo.terms2020-06-03
bora.peerreviewedNot peer reviewed
fs.embargotype1 years
fs.gradepass
fs.unitcode12-60-0
dc.rights.accessrightsembargoedaccess
dc.rights.termsPostponed access: the file will be accessible after 2020-06-03


Files in this item

Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record